Биографии катынцев-евреев до сих пор мало изучены исследователями. Согласно выводам авторитетного эксперта Вениамина Меиртчака, среди расстрелянных заключенных было не менее 438 человек еврейской национальности, из них 231 человек был расстрелян сотрудниками НКВД в Катыни, 188 в Харькове и 19 в Твери. Обычно это были офицеры запаса, в основном интеллигенция. Доктор Кемпнер был среди них.
Перед войной он гордился тем, что в квартире его бабушки проходило тайное заседание Национального правительства, возглавившего Январское восстание 1863 года. К сожалению, мало что известно о его молодости. Его отец, Станислав, был журналистом, популяризировавшим знания в области экономики. Следуя примеру своего учителя Александра Свентоховского (1849-1938), он влился в среду варшавских позитивистов. Его мать, Флора, тоже происходила из кругов ассимилированной еврейской интеллигенции. Она была дочерью известного издателя прессы Рудольфа Окренты.
Патриотизм, распространенный в семье, рано дал о себе знать в жизни Ежи. В 1905 году он был среди молодежи, объявившей школьную забастовку, требуя вернуть в школы польский язык вопреки царскому приказу. Участие в протесте стоило ему исключения из русской школы. Однако аттестат зрелости он получил, закончив обучение заочно, а затем отправился в Мюнхен изучать медицину.
Незадолго до войны он получил диплом врача и вернулся в Варшаву. В ноябре 1918 года вступил в Войско Польское и в январе следующего года принял участие в боях на Украинском фронте под Львовом в качестве врача 3-го стрелкового полка, а затем 36-го стрелкового полка Академического легиона. Он также участвовал в польско-большевистской войне — капитаном был назначен в 9-й тяжелый артиллерийский полк. Затем до демобилизации работал в госпитале в Кельце. Позже он практиковал в качестве психиатра в Варшаве.
В столице его можно было встретить в знаменитом кафе «Земянска» в доме 12 по ул. Мазовецкой. Над ним там нередко подшучивали, потому что добрый доктор, который сам был небогатым человеком, постоянно одалживал что-то разным «прекрасным душам» и заблудшим братьям, которые жили там по нескольку дней. Было общеизвестно, что, если у кого-то из них кончались деньги, всегда можно было обратиться к добродушному доктору.
После начала Второй мировой войны Кемпнер был взят в плен Красной Армией и отправлен в военный госпиталь в Тарнополе. Потом он попал в лагерь в Старобельске, откуда уже не вернулся. Он был убит в Харькове сотрудниками НКВД выстрелом в затылок.