6 ноября 1939 года немцы арестовали в Кракове 183 польских профессора и других ученых. Подавляющее большинство из них было перевезено в немецкий лагерь в Заксенхаузене. Некоторые из них не пережили задержания там.
После агрессии Третьего рейха против Польши Краков был оккупирован немцами 6 сентября 1939 года. С самого начала оккупанты применяли террор против жителей города. Согласно нацистской политике, Польша должна была стать резервуаром дешевой или даже бесплатной рабочей силы, необходимой для функционирования военной машины. Часть польских территорий, оккупированных Третьим рейхом, была включена в его состав напрямую, а из оставшейся части в октябре 1939 года было создано Генерал-губернаторство. Это квазигосударство возглавлял Ганс Франк. Краков, который был столицей Польши в течение многих лет до Варшавы, был назначен резиденцией оккупационных властей. В этом городе с 1364 года функционировал старейший польский университет — Ягеллонский университет, который на протяжении веков давал образование нескольким поколениям поляков и в котором работали многие выдающиеся и уважаемые во всем мире ученые.
Во второй половине октября 1939 года руководство университета приняло решение о возобновлении работы университета, установив, что начало нового учебного года состоится в понедельник, 6 ноября (позже эта дата была перенесена на неделю — на 13 ноября). Инаугурации по традиции предшествовала месса, отслуженная 4 ноября в академической церкви Святой Анны. Ректор Ягеллонского университета, профессор Тадеуш Лер-Сплавиньский, сообщил об этом оккупационному комиссару города Эрнсту Зёрнеру, который находился в должности с 27 сентября 1939 года, и не возражал против этих планов.
Однако совершенно иную позицию занял министр науки, образования и науки Германии Бернхард Руст, который в письме от 31 октября 1939 года, адресованном генерал-губернатору Гансу Франку, обязал его полностью предотвратить возобновление занятий в Ягеллонском университете. Чтобы добиться этого, немцы решили арестовать профессоров и других сотрудников университета. Они сделали это в рамках операции, которую историки позже назвали Sonderaktion Krakau, а сами оккупанты — Aktion gegen Universitäts Professoren, так как это было основанием для арестов, которые они записывали в учетные карточки заключенных.
3 ноября 1939 года профессор Тадеуш Лер-Сплавинский был встречен офицером СС Бруно Мюллером, который поручил ректору организовать встречу с сотрудниками университета 6 ноября. Мюллер должен был прочитать лекцию об отношении немцев к науке и высшему образованию. Ректор, не подозревая об обмане, поспешил оповестить научный персонал университета о дате встречи.
Во время военных действий в сентябре этот эсэсовец был командиром Einsatzkommando 2/I, подразделения, действовавшего в тылу фронта в Верхней Силезии и на Малопольше. Члены групировки несли ответственность за убийства польской интеллигенции на основании проскрипционных списков в Верхней Силезии. Впоследствии Мюллер также лично участвовал в уничтожении еврейского населения. После окончания Второй мировой войны он был арестован англичанами и приговорен к 20 годам тюрьмы, но был освобожден в 1953 году и не ответил за большинство совершенных им преступлений.
Лекция Мюллера должна была состояться 6 ноября 1939 года в аудитории 66 Colegium Novum Ягеллонского университета. Здания университета ранее были окружены немецкими силами безопасности, и в здании находилось много офицеров СС. Точно в 12.00 Бруно Мюллер вошел в зал и сделал короткое заявление. Вот как его содержание запомнилось присутствующим в аудитории преподавателям: «Здешний университет начал учебный год, не получив предварительно разрешения от немецких властей. Это плохая воля. Кроме того, хорошо известно, что его преподаватели всегда враждебно относились к немецкой науке. По этой причине все присутствующие, за исключением трех женщин, будут отправлены в концентрационный лагерь. Любое обсуждение или даже высказывание на эту тему исключается. Кто будет сопротивляться исполнению моего приказа, будет расстрелян».
По сигналу Мюллера в аудиторию вошли офицеры СС и начали выводить присутствующих ученых. Некоторые из них пытались протестовать и делать заявления. Однако это вызвало жестокую реакцию немцев, которые, надавали пощечин и пинали 70-летнего профессора Станислава Эстрейхера, бывшего ректора Ягеллонского университета.
В результате зондеракции Кракау нацисты задержали в общей сложности 183 человека, большинство из которых были сотрудниками Ягеллонского университета. Среди арестованных были также ученые из других университетов Кракова, а также из Университета имени Стефана Батория в Вильнюсе или Католического университета Люблина. Среди задержаных было много профессоров, уважаемых во всем научном мире.
Арестантов доставили в тюрьму на улице Монтелупих в Кракове, а затем заключили в здание бывших военных казарм на улице Мазовецкой. В конце ноября 1939 года они были доставлены в лагерь Заксенхаузен под Берлином. Здесь они встретились с Рудольфом Хёссом, который в то время командовал этим лагерем. Весной 1940 года Хёсс стал комендантом только что созданного концентрационного лагеря Аушвиц. В результате дипломатического давления и обращений зарубежных академических кругов немцы в феврале 1940 года освободили профессоров, родившихся до 1900 года; некоторые из остальных были переведены в концентрационный лагерь Дахау, откуда их последовательно освобождали. К сожалению, 20 из них не дожили до свободы. Среди прочих, вышеупомянутый профессор Эстрейхер и многие другие погибли в КЛ Заксенхаузен в декабре 1939 года. Позже немцы убили профессоров Леона Штернбаха и Иоахима Меттальмана, которые были еврейского происхождения.