Около 210 000 евреев и около 72 тыс. поляков погибли в Bezirk Białystok, основанном в июле 1941 года, на территории Белостокского района. Во время немецкой оккупации в него входили довоенное Белостокское воеводство (без Сувальского района), а также часть Пружанского и Брестского повятов бывшего Полесского воеводства. Осенью 1941 года к территории округа был присоединен Гродненский район.
Самое большое гетто находилось в Белостоке и насчитывало от 40 до 60 тысяч жителей. Его ликвидация началась в феврале 1943 года. Уцелевшее еврейское население переехало в т.н. маленькое гетто, которое скоро тоже прекратило свое существование. Депортация началась 8 сентября 1943 г., а его жителей отправили в лагеря смерти (Белжец, Освенцим-Биркенау) и концлагеря (Майданек).
Горстка уцелевших евреев работала на заводах по разборке машин, сортировке и перевозке еврейского имущества, которое свозили на склады, подчинявшиеся Treuhandstelle и расположенные на ул. Колейова. Позднее в поиске в гетто более ценных вещей помогали военнопленные, жившие в бараках у вокзала.
Последним трагическим событием, затронувшим белостокских евреев, стало создание Командо 1005, которое состояло из 43 человек. Его организовал Вальдемар Махолль (гауптштурмфюрер СС) с целью замести следы нацистских преступлений. В июле 1944 г. евреи из Командо 1005 узнали, что немцы хотят их убить, но их шансы на побег были ограничены так как они находились в тюрьме, откуда они отправлялись на «акции». Только во время казни «сжигатели», как их называли, решили бежать. Девяти из них удалось, 34 были расстреляны. Спустя 14 дней уцелевшие скрывались до окончания немецкой оккупации.
Выжили Хаим Врубель, свидетель на процессе Махолля в Белостоке, и Шимон Амиэль, сообщивший о том, как немцы пытались избавиться от улик преступления, убирая следы убийств. Он подтвердил, что в мае 1944 года из тюрьмы в Белостоке в течение восьми недель выезжала машина, в которой закованных в наручники членов Командо доставили к местам массовых убийств под Августовом, Гродно, Седльцами и Белостоком, где им было приказано под угрозой смерти сжечь трупы, перемолоть кости и развеять пепел.
Подсчитано, что из всех обитателей гетто только 260 человек пережили войну, в основном в лагерях и партизанских отрядах, а также скрываясь на «арийской стороне».