ויטולד פילצקי נולד ב-13 במאי 1901 באולונץ שבצפון רוסיה. אבותיו נשלחו לשם על ידי רשויות הצאר כדי להשתתף במרד ינואר של 1863. זמן קצר לפני פרוץ מלחמת העולם הראשונה, עברה משפחת פילצקי לווילנה.
ב-1918 הצטרף ויטולד הצעיר לשורות הצבא הפולני המתהווה. הוא גם השתתף במלחמה הפולנית-בולשביקית. לאחר סיום לימודיו הוא עבר את בחינות הבגרות והחל ללמוד בפקולטה לאמנות יפה באוניברסיטת וילנה. הוא לא סיים את לימודיו מסיבות משפחתיות. פילצקי הפך לבעלים של קרקעות בסוקורצ'ה (כיום בלארוס), שם ביצע מודרניזציה יסודית. פילצקי היה מעורב באופן פעיל בחיי הקהילה המקומית, והקים מועדון חקלאי ומחלבה. ב-1931 הוא נישא למריה אוסטרובסקה. במהרה נולדו להם בן, אנדז'יי, ובת, זופיה.
ב-1939 פילצקי השתתף במלחמת ההגנה נגד גרמניה בשורות דיוויזיית חיל הרגלים ה-19, ולאחר מכן בדיוויזיה ה-41. בוורשה הכבושה הוא היה ממייסדי ארגון המחתרת של הצבא הפולני הסודי. בספטמבר 1940 הוא ביצע פעולה נועזת. במהלך סיבוב ברחוב, הוא נעצר כדי להגיע למחנה אושוויץ. הוא נשלח לשם תחת שמו של תומאש סרפינסקי ויצר שם רשת מחתרתית. הוא גם אסף והעביר מידע מודיעיני על מבנה המחנה ותפקודו.
בלילה ה26-27 באפריל 1943, נמלטו פילצקי ושני אסירים אחרים מאושוויץ. לאחר מספר חודשים הוא הגיע לוורשה והמשיך להילחם בשורות צבא הבית.
כשפרץ מרד ורשה פילצקי הצטרף אליו ולאחר נפילת המרד, הוא נפל בשבי הגרמנים. לאחר מכן, לאחר כניעת הרייך השלישי, שירת בחיל הפולני השני באיטליה. משם, בסתיו 1945, הוא נשלח לפולין תחת שלטון הקומוניסטים כדי לארגן רשת מודיעין. משימתו הייתה לאסוף מידע על שיטות הדיכוי ששימשו את השלטונות הסובייטיים והפולניים (הקומוניסטיים) ועל מבני הביטחון שלהם.
במאי 1947 נעצר פילצקי. לאחר חקירה אכזרית, במרץ 1948, גזר עליו בית המשפט המחוזי הצבאי בוורשה גזר דין מוות. גזר הדין בוצע ב-25 במאי 1948. גופתו נקברה בחשאי על ידי הקומוניסטים ולא נמצאה עד היום.