יונתן ורשאואר עסק ברפואה ובפוליטיקה. כיהודי, הוא כיוון להתבוללות אחיו היהודים בעם הפולני. כפוליטיקאי תמך בשאיפות העצמאות של פולין במאה ה-19.

יונתן ורשאואר נולד ב-2 במרץ 1820 בקרקוב. הוא למד שם בגימנסיית סנט אנה. בשנת 1843, הוא סיים דוקטורט ברפואה מהפקולטה לרפואה של האוניברסיטה היגילונית בקרקוב. עם זאת, הוא לא עסק רק ברפואה.

בשנת 1846 פרץ מרד קרקוב, וקרקוב הייתה חלק ממדינה בשם הרפובליקה של קרקוב, שהייתה תלויה באוסטריה, רוסיה ופרוסיה. שלוש המדינות הללו ביצעו באלימות שלוש חלוקות של פולין במאה ה-18, מה שהוביל למחיקת פולין ממפת אירופה. מרד קרקוב היה אחד מכמה ניסיונות פולנים לפרוץ לעצמאות.

המרד נתמך על ידי יונתן ורשאואר. התברר שהוא לא רק רופא פולני מצוין ממוצא יהודי, אלא גם חסיד גדול של עצמאות פולין והתבוללות יהודים בעם הפולני. הוא נכלא בשל תמיכתו במרד קרקוב. הוא גם היה נלהב לגבי מרד פוזנן של 1848, חלק מאביב העמים. באותו זמן הוא דחק ביהודי פולין הגדולה לתמוך בשאיפות הפולניות.

בשנים 1848 ו-1866 הוא נבחר למועצת העיר קרקוב. אולם שאיפותיו הגיעו גבוה יותר, כאשר ניסה להיות חבר בפרלמנט הלאומי וגם במועצת המדינה של וינה. למרבה הצער, הוא לא הצליח – כנראה בגלל תמיכתו הנלהבת בהתבוללות של יהודים עם פולנים. על דעותיו מעידה החוברת "על הפולוניזציה של יהודי גליציה" משנת 1882.

ורשאואר ניהל מרפאה עצמאית. הוא פרסם בכתבי עת רפואיים. ב-1880 הוא הפך לנשיא החברה הרפואית של קרקוב.

הוא נפטר ב-10 בנובמבר 1888 בקרקוב.