במהלך הכיבוש הגרמני, יותר מ-2,200 אנשים מתו או נרצחו בכלא טירת לובלין מאז 1939. כ-4,500 אסירים נוספים הוצאו להורג בלובלין ובסביבתה. הרצח האחרון בוצע על ידי הגרמנים שעות ספורות לפני שעזבו את לובלין לפני הצהריים ב-22 ביולי 1944.

בתקופה של 1939-1944 שימש כלא טירת לובלין (המבנה שימש למטרה זו גם בתקופת רוסיה הצארית והרפובליקה הפולנית השנייה) כבית הכלא הראשי במחוז לובלין של הממשל הכללי. הוא הפך במהרה למקום הוצאה להורג של עשרות אלפי אנשים ונחשב לאחד מבתי הכלא הכבדים בפולין הכבושה על ידי הגרמנים. בין 1939 ל-1944 הנאצים כלאו שם יותר מ-40,000 איש. גם התנאים ששררו בכלא תרמו לשיעור התמותה הגבוה בקרב האסירים. התאים היו צפופים במידה מאוד. לעתים קרובות טיפול רפואי בסיסי נמנע מאסירים שהיו תחת חקירות אכזריות. בתקופת בין המלחמות, קיבולת הכלא הייתה 700 אסירים. אולם במהלך הכיבוש, הגרמנים אילצו לעתים קרובות כמעט 2,500 אנשים להידחק באותם חדרים. בין 1939 ל-1944, יותר מ-220 בני אדם נרצחו או מתו בשטח הכלא. עוד 4,500 הוצאו להורג בתוך לובלין ובערי הסביבה. יותר מ-18,000 אסירים נלקחו למחנות ריכוז, שם מתו יותר מ-3,500 מהם. אסירי כלא טירת לובלין היו חיילי תנועת ההתנגדות הפולנית, נציגי האינטליגנציה שלפני המלחמה, כמרים ויהודים.

כשהחיילים הסובייטים התקרבו ללובלין ביולי 1944, החלו הגרמנים בחיסול הכלא. במשך שלושה ימים, בין ה-19 ל-21 ביולי 1944, הנאצים גירשו יותר מ-1,100 בני אדם ורצחו אותם ב-KL מיידנק-לובלין, או המיתו אותם בגז לאורך הדרך בקרונות שהוכנו במיוחד. ב-22 ביולי 1944, בשעה 9 בבוקר, הגיעה לכלא קבוצת גסטפו בהובלת ה-SS-Hauptsturmführer הרמן וורטהוף. הגרמנים עשו את דרכם לאחד האגפים, שם החלו לירות באסירים דרך הסורגים. לאחר מכן הם טבחו ביהודים (כולל נשים וילדים) שעבדו בסדנה של חייט הכלא, ולאחר מכן הביאו לשם אסירים מתאים אחרים ורצחו אותם לכאן. למעלה מ-300 אסירים נרצחו בטבח שנמשך שעתיים. סביב שעת הצהריים עזבו כל הגרמנים את הכלא. עד מהרה החלו להיכנס תושבי לובלין בחיפוש אחר קרוביהם. כ-170 מהנרצחים נלקחו ונקברו על ידי משפחותיהם. האחרים נקברו בקבר אחים בפינה הדרומית של הטירה. משם הוצאו אל בית הקברות ברחוב ליפובה בלובלין בסוף פברואר 1954.